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AI賦能的微生物組大數(shù)據(jù)挖掘：方法與應(yīng)用

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  • ISBN：978-7-5478-6237-7
  • 作者：寧康 編著
  • 定價(jià)：￥88 元
  • 出版時(shí)間：2023-08-01
  • 版次：01
  • 印次：01
  • 裝幀：
  • 紙張：
  • 開(kāi)本：16
  • 字?jǐn)?shù)：
  • 頁(yè)數(shù)：

       微生物組學(xué)（microbiomics）是繼基因組學(xué)之后，生物學(xué)研究領(lǐng)域的重大突破之一。特別是近20年來(lái)，國(guó)際上有關(guān)微生物組學(xué)的研究進(jìn)展極其迅速，不僅積累了上百萬(wàn)的微生物群落樣本，而且在人體健康、環(huán)境保護(hù)、工業(yè)生產(chǎn)等方面發(fā)掘了大量的微生物資源，發(fā)現(xiàn)了大批的微生物變化規(guī)律。當(dāng)今人工智能（AI）技術(shù)一日千里，將其運(yùn)用于微生物組的大數(shù)據(jù)挖掘，可極大地促進(jìn)微生物資源的理性轉(zhuǎn)化與應(yīng)用。本書(shū)較為全面系統(tǒng)性地梳理了AI賦能微生物組的基本概念和分析流程，以及21世紀(jì)前20年來(lái)相關(guān)數(shù)據(jù)挖掘方法和典型應(yīng)用案例，并對(duì)其未來(lái)發(fā)展趨勢(shì)和應(yīng)用潛力進(jìn)行了總結(jié)與展望，可供微生物組研究相關(guān)的科研工作者，以及對(duì)組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘感興趣的師生參考。

目  錄

 

第1章微生物組1

 

11基本概念1

 

111微生物群2

 

112宏基因組4

 

113微生物組5

 

12微生物組高通量測(cè)序5

 

121擴(kuò)增子測(cè)序6

 

122宏基因組測(cè)序7

 

123測(cè)序技術(shù)的發(fā)展9

 

124鳥(niǎo)槍法宏基因組測(cè)序的拓展研究11

 

13微生物組測(cè)序數(shù)據(jù)和基本分析流程14

 

小結(jié)16

 

參考文獻(xiàn)16

 

 

第2章微生物組大數(shù)據(jù)及其主流分析方法20

 

21基本概念及分類(lèi)20

 

22微生物組大數(shù)據(jù)的特征22

 

23微生物組的主流數(shù)據(jù)庫(kù)23

 

24微生物組的主流數(shù)據(jù)分析方法和軟件24

 

241擴(kuò)增子分析軟件27

 

242宏基因組分析軟件27

 

243統(tǒng)計(jì)和可視化工具28

 

25微生物組數(shù)據(jù)整合中的批次效應(yīng)28

 

 

 

251平均中心方法30

 

252Zscore方法30

 

253基于比值的方法31

 

254距離加權(quán)判別法31

 

255ComBat方法31

 

256基于奇異值分解方法31

 

257替代變量分析法31

 

26微生物數(shù)據(jù)分析流程32

 

26116S擴(kuò)增子數(shù)據(jù)分析流程33

 

262宏基因組數(shù)據(jù)分析流程35